1、遗传和家族因素
约20%～25%的的患者直系亲属中患有卵巢囊肿，这在一定程度上说明卵巢囊肿可能与遗传和家庭因素相关。
2、内分泌因素
卵巢是产生卵子并承担排卵的器官，同时还承担着分泌激素的功能。处于生育年龄，并且内分泌旺盛的女性，多易病发卵巢囊肿；相关研究称，妊娠似乎对卵巢囊肿有对抗作用；乳腺癌、子宫内膜癌多并发卵巢囊肿，以上情况均在一定程度上说明内分泌因素可能是引发卵巢囊肿的重要原因之一。
3、环境因素
在工业比较发达的国家，女性卵巢囊肿的发病率会高一些，可能与饮食中高胆固醇等因素有关，电离辐射、石棉及滑石粉等因素也可影响卵母细胞，从而诱发卵巢囊肿。