原因不明性不孕症是指夫妇有正常性生活，女方有排卵，经妇科检查及全面检查未发现异常，男方精液及其他检查亦均正常，但两年以上未怀孕者。也就是说双方均未查出与不孕有关的原因。据报道，原因不明性不孕的发生率约占不孕症的10％。根据近年的研究，就目前医学科学水平而言，原因不明性不孕症的可能原因有以下几种：
（1）免疫因素，女方血清中或宫颈粘液中含有抗精子抗体，使精子凝集而影响精子的活力。
（2）卵子不健全，虽有排卵而不能受孕。
（3）内分泌功能不足。
（4）黄素化未破裂卵泡，从基础体温曲线看似有排卵，但实际并未排卵而卵泡直接发生黄素化。
（5）子宫后倾。
（6）隐性流产。
（7）其他。如思想负担过重、焦虑，隐匿性全身性疾病，男性有轻微性功能障碍，性交次数减少等等。