1、长期的饮食结构：生活习惯不好、心理压力过大等因素造成体质过度酸化，人体整体的机能下降，引起肾虚，肝肾同源，肾虚肝亦虚，进而引起下焦代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，从而发展为卵巢组织异常增生，终致卵巢囊肿，甚至癌变。这是常见的引起卵巢囊肿的原因。
2、内分泌因素：未产妇或未育妇的发病率增加，而妊娠对卵巢癌似有保护作用；月经初潮偏早（12岁之前）、绝经时间在50岁之后、月经过频、应用促排卵剂超过3个周期（使用时应与您的医师讨论）、性早熟或男性化等也与卵巢囊肿的原因有关。
3、环境因素：膳食结构不合理，高胆固醇饮食、而维生素A、C、E的缺乏、吸烟、电离辐射等环境因素与其发生有关。这也是常见的引起卵巢囊肿的原因。